Yayasan El Masrum Kota Tual terbentuk sebagai refleksi panjang kerja-kerja untuk meneguhkan nilai nilai kemanusiaan di Kepulauan Kei terutama di Kota Tual. Bermula dari kerusuhan sosial yang terjadi di tahun 1999, mendorong beberapa orang bekerja secara sukarela membantu melakukan kerja-kerja kemanusiaan di tengah konflik yang berkecamuk. Namun kerja-kerja tersebut masih bersifat sporadis dan berjalan sendiri tanpa ada kordinasi yang jelas sehingga menyulitkan kordinasi dengan lembaga lain yang concern pada perdamaian dan penyelesaian konflik. Sehingga beberapa dari mereka kemudian menginisasi terbentuknya TRK (Tim Relawan Kemanusiaan) yang bertugas membantu masyarakat yang membutuhkan bantuan terutama sandang dan pangan, dan investigasi,dokumentasi dan advokasi, serta pendampingan korban pasca konflik.Tugas Tim Relawan Kemanusiaan saat itu membangun Kerjasama dengan beberapa Lembaga seperti Jaringan Baileo Maluku maupun dengan YNMI (Yayasan Nen Mas Il) kedua Lembaga tersebut memiliki komitmen dalam mendorong perdamaian di Maluku. Dari sinilah Yayasan El Masrum Kota Tual terbentuk. Paska konflik Yayasan El Masrum terus terlibat dalam pendampingan pada masyarakat terutama pada beberapa isu isu diantara;Pangan dan Gizi, Pembangunan Berbasis Masyarakat,Kesetaraan Gender, serta advokasi hukum bagi masyarakat miskin. Secara Filosofis El Masrum berarti tempat berkumpul, berasal dari bahasa lokal setempat. Bagi para inisiator berharap kelak Lembaga ini menjadi wadah berkumpul bagi para pegiat isu isu kemanusian dapat membahas sekaligus memutuskan hal-hal strategis menyangku isu isu kemanusiaan. Sampai hari ini Yayasan El Masrum masih Sampai hari ini Yayasan El Masrum masih terus berkiprah selain isu kemanusian, Lembaga ini juga masih merespon isu-isu Ketahanan pangan, Gender, dan Pengembangan ekonomi masyarakat lokal. Saat ini Yayasan El Masrum telah berbadan hukum dan terdaftar di Kementerian Hukum dan HAM dengan Nomor: AHU – 1154.AH 01.04 Tahun 2014.